中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室

中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台

DNA Barcode of Rare and Endangered Plant (BREP)

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程涛

研究兴趣及研究领域:

1.系统发育重建

通过分析比较不同的系统发育方法在不同的计算机软硬件条件下的性能差异,寻找适合不同规模数据的最佳软硬件处理策略。

2. DNA条形码

利用现有的DNA数据,评估和设计DNA条形码相关Marker的通用引物。

联系方式:chengtao@ibcas.ac.cn

论文目录

[1] Wenpan Dong*, Tao Cheng*, Changhao Li*, Chao Xu, Ping Long, Chunming Chen, Shiliang Zhou. Discriminating plants using the DNA barcode rbcLb: an appraisal based on a large dataset. Molecular Ecology Resource, * Co first author, Under review

[2] Wenpan Dong, Chao Xu, Tao Cheng, Shiliang Zhou. Complete chloroplast genome of Sedum sarmentosum and chloroplast genome evolution in Saxifragales. PLOS ONE, Under review

[3] Wenpan Dong, Chao Xu, Tao Cheng, Shiliang Zhou. Sequencing angiosperm plastid genomes made easy: A complete set of universal primers and a case study on the phylogeny of Saxifragales. Genome Biology and Evolution, 2013. doi:10.1093/gbe/evt063

[4] Jianhua Xue, Wenpan Dong, Tao Cheng, Shiliang Zhou. Nelumbonaceae: systematic position and species diversification revealed by the complete chloroplast genome. Journal of Systematics and Evolution, 2012. 50(6): 477-487 (Cover story)

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